být nadměrný, proto se nedoporučuje lidem s diagnostikovaným syndromem dráždivého tračníku a močopudné vlastnosti mohou ovlivnit ledviny, v případě onemocnění ledvin.
Nedoporučuje se lidem, kteří mají zvýšenou činnost štítné žlázy, stejně jako veškerou zeleninu z čeledi brukvovitých musí lidé trpící hypertyreózou konzumovat s velkou opatrností, zvláště pokud je konzumována syrová a ve velkém množství.
V těhotenství se doporučuje konzumovat jen malé množství čerstvého křenu, upraveného do omáček nebo salátů, ale je třeba se mu v prvním trimestru vyhnout, protože některé sloučeniny by mohly způsobit potrat. Neměly by ho konzumovat kojící ženy, protože některé látky v něm obsažené končí v mateřském mléce a mohou být pro dítě toxické.
Křen může prostřednictvím svých sloučenin interagovat s levothyroxinem, což je syntetická forma hormonu štítné žlázy, široce používaná k léčbě hypotyreózy.
